Hay un numeroso grupo de aves que son difíciles de observar en otros lugares de la Amazonía, pero que son relativamente comunes en los bosques inundables de ríos de aguas negras o mixtas del área de Iquitos, incluyendo las secciones más antiguas de las islas grandes del Amazonas. En los bosques inundables por aguas negras (especialmente el río Nanay, pero también en las orillas de lagos fluviales, caños y áreas inundadas estacionalmente más alejadas de las orillas de los ríos de aguas blancas) es posible observar las siguientes especies:
- Zebrilus undulatus (Garza Cebra)
- Nyctriprogne leucopyga (Chotacabras Colibandeada)
- Laterallus fasciatus (Gallineta Negrilineada)
- Touit purpurata (Periquito Lomizafiro)
- Celeus spectabilis (Carpintero Cabecirrufo)
- Notharchus tectus (Buco Pinto)
- Automolus rufipileatus (Rascahojas Coronicastaña)
- Hylophilus thoracicus (Verdillo Pechilimón)
- Metopothrix aurantiacus (Coronifelpa Frentinaranja)
- Myrmotherula multostriata (Hormiguerito-Rayado Amazónico)
- Myrmotherula cherriei (Hormiguerito de Cherrie)
- Myrmotherula longicauda (Hormiguerito Pechilistado)
- Sakesphorus canadensis (Batará Copetón)
- Hylophylax punctulata (Hormiguerito Lamipunteado)
- Schiffornis major (Schiffornis de Várzea)
- Sublegatus obscurior (Mosquerito-Matorralero Amazónico)
- Knipolegus poecilocercus (Viudita Negra Amazónica)
- Hylophilus semicinereus (Verdillo Pechigris).
En los pantanos de palmeras que sedesarrollan en las áreas de mal drenaje de las llanuras inundables de los ríos es frecuente observar a especies como:
- Berlepschia rikeri (Trepador de Palmeras)
- Tyrannopsis sulphurea (Mosquero Azufrado)
- Attila citriniventris (Atila Ventricitino)
- Ocyalus latirostris (Oropéndola Colifajeada).
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